Formado en Old Georgian, Eduardo Morgan debutó en Los Pumas el 21 de octubre de 1972, enfrentando a Gazelles en la cancha de Ferro Carril Oeste, oportunidad en que el seleccionado nacional cayó 14-6. Ese día Morgan anotó dos penales para el seleccionado nacional.
Morgan, hermano menor de Miguel y Dudley, quienes también integraron Los Pumas, jugó doce partidos en el seleccionado, entre 1972 y 1975, año en que disputó sus últimos tests enfrentando a Francia y siendo capitán del equipo.
